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 建立北京生命科学研究所是中国政府在发展生命科学技术领域的重要战略之一。基本原则是：把握时机，以改革试点的方式，采用与国际接轨的管理和运行机制，以国际一流科学家集体为基础，争取在尽可能短的时间内组建国际一流的基础生命科学研究所。北京生命科学研究所的主要任务是：进行原创性基础研究，同时培养优秀科研人才，探索新的与国际接轨而又符合中国发展的科研运作机制。研究所实行理事会领导下的所长负责制，理事会是研究所的决策机构。第一任科学指导委员会由理事会聘任国内外著名科学家，组成科学指导委员会。科学指导委员会是学术咨询机构，其主要任务是对研究所所长进行聘任前的学术评估，提出推荐意见；对研究所的研究工作做出评估并提出建议。