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中国科学院上海巴斯德研究所是根据中国科学院、上海市和法国巴斯德研究所2004年8月30日签署的合作总协议建立的研究机构。2005年7月开始运行。现任所长为唐宏，科研联合所长为安瑞璋。上海巴斯德所恪守使命，力争在分子病毒学和抗病毒免疫领域成为国际一流研究机构，为传染性疾病预防与控制作出贡献。研究的战略方向主要集中在基础研究和转化型研究：- 病毒的分子生物学，急性或慢性感染的机制；- 免疫应答机制和病毒感染调节；- 新型疫苗研发。
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