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 南宁住房公积金管理中心成立于l993年9月8日，前身为广西首府南宁住房资金管理中心，隶属于南宁市住房制度改革委员会办公室的自收自支事业单位。2003年11月1日，根据《住房公积金管理条例》（国务院令第350号）和《国务院关于进一步加强住房公积金管理的通知》（国发〔2002〕12号）的文件精神，经南宁市人民政府批准，在广西首府南宁住房资金管理中心的基础上，对包括县住房资金管理中心的机构和人员进行重组后，成立南宁住房公积金管理中心，是直属于南宁市人民政府的不以营利为目的的独立的参照公务员法管理的正处级事业单位。